企業(yè)所得稅法規(guī)定，符合條件的居民企業(yè)之間的股息、紅利等權(quán)益性投資收益屬于企業(yè)所得稅免稅收入。所稱符合條件的居民企業(yè)之間的股息、紅利等權(quán)益性投資收益是指居民企業(yè)直接投資于其他居民企業(yè)取得的投資收益(不包括連續(xù)持有居民企業(yè)公開發(fā)行并上市流通的股票不足12個月取得的投資收益)。合伙企業(yè)對外投資分回的股息紅利不并經(jīng)營所得，應當單獨先分后稅，對于法人合伙人應取得的股息紅利：首先合伙企業(yè)不是居民企業(yè);其次，法人合伙人是通過合伙企業(yè)間接投資的方式(而非直接投資方式)。因此法人合伙人通過非居民企業(yè)間接投資于其他居民企業(yè)而取得的股息、紅利等權(quán)益性投資收益，不符合企業(yè)所得稅免稅收入條件。即居民企業(yè)間接投資取得稅后分紅不能穿透適用免稅優(yōu)惠政策。
企業(yè)所得稅法規(guī)定，創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)可以按照其對中小高新技術(shù)企業(yè)投資額的70%，在股權(quán)持有滿2年的當年抵扣該創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)的應納稅所得額;當年不足抵扣的，可以在以后納稅年度結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。那么，對于法人合伙人通過有限合伙企業(yè)間接投資中小高新技術(shù)企業(yè)能不能穿透適用按投資額70%抵減應納稅所得額呢?可以穿透!對于依照《中華人民共和國合伙企業(yè)法》、《創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)管理暫行辦法》和《外商投資創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)管理規(guī)定》設立的專門從事創(chuàng)業(yè)投資活動的有限合伙企業(yè)，法人合伙人是實行查賬征收企業(yè)所得稅的居民企業(yè)，根據(jù)《國家稅務總局關(guān)于有限合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)法人合伙人企業(yè)所得稅有關(guān)問題的公告》(國家稅務總局公告2015年第81號)規(guī)定，有限合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)采取股權(quán)投資方式投資于未上市的中小高新技術(shù)企業(yè)滿2年(24個月)的，其法人合伙人可按照對未上市中小高新技術(shù)企業(yè)投資額的70%抵扣該法人合伙人從該有限合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)分得的應納稅所得額，當年不足抵扣的，可以在以后納稅年度結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。
另據(jù)財稅〔2017〕38號、國家稅務總局公告2017年第20號規(guī)定，有限合伙制創(chuàng)業(yè)投資企業(yè)采取股權(quán)投資方式直接投資于初創(chuàng)科技型企業(yè)滿2年(24個月)的，法人合伙人可以按照對初創(chuàng)科技型企業(yè)投資額的70%抵扣法人合伙人從合伙創(chuàng)投企業(yè)分得的所得;當年不足抵扣的，可以在以后納稅年度結(jié)轉(zhuǎn)抵扣。
以上是關(guān)于合伙企業(yè)法人合伙人實體穿透的規(guī)定，意味著沒有明文規(guī)定，合伙企業(yè)不能適用實體穿透的相關(guān)政策，否則，就沒有必要對從事創(chuàng)業(yè)投資的有限合伙企業(yè)法人合伙人專門出臺一項優(yōu)惠政策。
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